Нокаутна мышь - генетически измененная домашняя мышь, у которой экспрессия одного или нескольких генов выключена с помощью нокаута генов. Нокаутни мыши важны моделями для исследования генов животных, которые были секвеновани, но функция которых неизвестна. Инактивирующей специфический ген у мыши и исследуя изменения ее фенотипа (поведения, внешнего вида), исследователи часто могут сделать выводы о функции данного гена.
Мыши является ближайшим к человеку модельным организмом, к которому может применяться подобная методика исследования, даже для крыс ее применения гораздо сложнее. Поэтому мыши широко используются в исследованиях, касающихся физиологии человека.
Первая нокаутна мышь была создана Марио Капеччи, Мартином Эвансом и Оливером Смитизом в 1989 году, за что они были награждены Нобелевской премией по физиологии и медицине 2007 года. Много вариантов метода были разработаны позже, некоторые из них запатентованы частными компаниями.